虽然即时通信（IM）作为网络营销工具在网络营销的应用中有许多优点，但同时也存在一些问题。 即时通信（IM）在网络营销应用中的限制因素主要表现在下列三个方面：
（1）即时通信软件繁多，用户有一定的分散性。由于IM工具较多，不同的用户可能使用不同的 即时通信软件，各种软件之间不能直接交流，这样需要同时采用多种IM软件才能和多个用户进行交流。不过也存在这样的发展趋势：各种不同的即时通讯工具之间将可以实现互通，那时 即时通信的应用将更为方便，信息传递也将更加有效。
（2）传递大量信息或者一对多信息有困难。并不是任何信息都适合实时交流，比如有大量内容的信息、促销信息等，如果采用实时信息的方式，必然对接收者带来麻烦，因此还是需要电子邮件来承担这些任务。虽然从技术上可以做到同时向多个用户发送 即时通信，事实上也有一些企业和个人在利用这种方式开展“网络营销”如利用IE浏览器的“信使服务”和和和QQ群发信息等，由于对接收者造成干扰，因此这种方法很容易受到指责，严重者将会被起诉，总体效果并不理想。
（3）即时通信传递信息不够规范。在商务活动中，通过这种实时聊天的形式进行信息交换显得不正规，也不便于对交流信息进行分类管理，同时还存在信息安全方面的隐患，用 即时通信方式所发出的要约和承诺目前还无法被确认为有效的合同，当出现纠纷时受损失一方难以提出有效的证据。因此在正规的商业活动中 即时通信还不能代替电子邮件等其他比较规范的电子信息传递方式。
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